.
**۱. نرم‌افزارهای تحلیل داده‌های ژنتیک و بیوانفورماتیک**
- **BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)**
- **کاربرد**: مقایسه توالی‌های DNA، RNA و پروتئین
- **لینک دانلود**: [NCBI BLAST]
- **CLC Genomics Workbench**
- **کاربرد**: آنالیز داده‌های NGS، اسمبل ژنوم، آنالیز بیان ژن
- **لینک دانلود**: [Qiagen CLC]
- **Geneious**
- **کاربرد**: آنالیز توالی‌های DNA/RNA، طراحی پرایمر، تراز توالی‌ها
- **لینک دانلود**: [Geneious]
- **MEGA (Molecular Evolutionary Genetics Analysis)**
- **کاربرد**: فیلوژنی، تراز توالی‌ها، آنالیز تکاملی
- **لینک دانلود**: [MEGA]
- **BioEdit**
- **کاربرد**: ویرایش و آنالیز توالی‌های بیولوژیکی
- **لینک دانلود**: [BioEdit]
**۲. نرم‌افزارهای شبیه‌سازی و مدل‌سازی مولکولی**
- **PyMOL**
- **کاربرد**: مدل‌سازی سه‌بعدی پروتئین‌ها و مولکول‌ها
- **لینک دانلود**: [PyMOL]
- **Chimera & ChimeraX**
- **کاربرد**: تجسم ساختارهای پروتئینی و مولکولی
- **لینک دانلود**: [UCSF Chimera]
- **Swiss-PdbViewer (DeepView)**
- **کاربرد**: مدل‌سازی و آنالیز ساختار پروتئین
- **لینک دانلود**: [Expasy Swiss-PdbViewer]
### **۳. نرم‌افزارهای تحلیل داده‌های NGS (Next-Generation Sequencing)**
- **FastQC**
- **کاربرد**: کنترل کیفیت داده‌های NGS
- **لینک دانلود**: [FastQC]
- **IGV (Integrative Genomics Viewer)**
- **کاربرد**: تجسم داده‌های ژنومی
- **لینک دانلود**: [IGV]
- **Cytoscape**
- **کاربرد**: تحلیل شبکه‌های پروتئین-پروتئین و مسیرهای زیستی
- **لینک دانلود**: [Cytoscape]
**۴. نرم‌افزارهای طراحی پرایمر و PCR**
- **Primer3**
- **کاربرد**: طراحی پرایمر برای PCR
- **لینک دانلود**: [Primer3]
- **OligoCalc**
- **کاربرد**: محاسبه خصوصیات اولیگونوکلئوتیدها
- **لینک آنلاین**: [OligoCalc]
**۵. نرم‌افزارهای آماری و برنامه‌نویسی برای بیوانفورماتیک**
- **R & Bioconductor**
- **کاربرد**: تحلیل آماری داده‌های زیستی
- **لینک دانلود**: [R Project] | [Bioconductor]
- **Python (با کتابخانه‌های Biopython, Pandas, NumPy)**
- **کاربرد**: برنامه‌نویسی برای تحلیل داده‌های زیستی
- **لینک دانلود**: [Python]
**۶. پایگاه‌های داده و ابزارهای آنلاین**
- **NCBI (National Center for Biotechnology Information)**
- **لینک**:
- **UniProt**
- **لینک**
- **KEGG Pathway**
- **لینک
---
