رایان زیست آریا

در طراحی پرایمر، **تعداد mismatch (ناسازگاری) مجاز کاملاً به موقعیت و هدف طراحی بستگی دارد، اما به طور کلی میتوان اینگونه خلاصه کرد:  

 🔬 قوانین کلیدی:
1. **انتهای ′3 پرایمر (بسیار حیاتی!)**  
  - **حداکثر ۰ mismatch** توصیه میشود.  
  - حتی **۱ mismatch در ۳-۲ نوکلئوتید انتهایی** میتواند اتصال پلیمراز را مختل کرده و PCR را کاملاً شکست دهد.  
  - *استثنا:* در تکنیکهایی مثل **ARMS-PCR** برای تشخیص SNP، یک mismatch عمدی در انتهای ′۳ ایجاد میشود تا اتصال آلل خاصی مسدود شود.

ادامه